L'église de Sainpuits est dédiée à Sainte Marie-Madeleine. Son plan est formé d'une simple nef érigée principalement à la fin du XV° et au début du XVI° siècle. Elle fut modifiée, probablement restaurée et aménagée après la guerre de Cent ans qui ravagea ces contrées, sur les bases de l'édifice primitif dont l'époque de construction remonterait au XII° siècle. Ceci peut être vérifié par l'observation de quelques maçonneries de la nef ainsi que l'édicule qui flanque la façade nord.

Son importante tour-clocher s'impose à l'ouest et renferme un portail flamboyant. Une grille en fer forgée – œuvre d'un artiste de la région (Franck Mercky) – protège l'entrée par le portail principal tout en laissant découvrir l'intérieur de l'édifice .Le portail date du milieu du XVI° siècle. Il est constitué d'un très bel appareil de pierres de taille s'achevant par une balustrade flamboyante ceinturant une coursive servant de belvédère et dominant ainsi le village et ses environs. Le dôme en pierre de ce clocher était autrefois ponctué d'une croix en pierre qui a malheureusement disparu au XIX° siècle si l'on en croit ce que rapporte Victor Petit dans son ouvrage sur "Les environs d'Auxerre" à propos de cette église. Elle fut d'ailleurs remplacée par une croix en pierre installée au-dessus du dôme de la tourelle d'escalier.

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